Аберрантная экспрессия гена CHL1 и длинной некодирующей РНК CHL1-AS1, CHL1-AS2 при эндометриозе яичников
ЦЕЛЬ
CHL1 (близкий гомолог L1 или молекулы клеточной адгезии, сходной с L1), также называемый CALL, является представителем семейства генов L1 молекул клеточной адгезии нейронов и принадлежит к надсемейству иммуноглобулинов. Данное исследование направлено на изучение потенциальной корреляции гена CHL1 и длинных некодирующих РНК (lncRNA), т. е. CHL1-AS1 и CHL1-AS2, и на проверку паттернов экспрессии CHL1 и CHL1-AS2 при эндометриозе яичников (ЭМ).
ДИЗАЙН ИССЛЕДОВАНИЯ
Наши предыдущие анализы микрочипов (GSE86534) у 4 пациенток с эндометриозом яичников показали, что CHL1 является мРНК с наиболее высокой экспрессией в тканях эктопического эндометрия (ЭК) по сравнению с тканями эутопического эндометрия (ЭУ), и что ее две антисмысловые lncRNA CHL1-AS1 и CHL1-AS2 демонстрировали ту же картину экспрессии. Мы использовали биоинформатическую стратегию расчета корреляции между CHL1, CHL1-AS1 и CHL1-АС2.
Был проведен анализ представленности функциональных групп генов (GSEA) для анализа предварительно обогащенных наборов генов для CHL1-AS1 и CHL1-AS2. Мы исследовали уровни экспрессии мРНК CHL1 и lncRNA CHL1-AS2 в парных тканях ЭК и ЭУ, полученных у 30 пациенток с ЭМ, и в нормальных тканях эндометрия (НЭ), полученных у 27 контрольных пациенток с использованием количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени (qPCR). Мы также исследовали экспрессию белка CHL1 в тканях ЭК, ЭУ и НЭ с помощью методов вестерн-блотт и иммуногистохимии (ИГХ).
РЕЗУЛЬТАТЫ
CHL1, CHL1-AS1 и CHL1-AS2 достоверно коррелировали друг с другом, принимая во внимание, что значения корреляции Пирсона были > 0,9 при биоинформационном расчете. GSEA показал, что CHL1-AS1 и CHL1-AS2 имели отрицательную взаимосвязь с одним и тем же набором генов “WAMUNYOKOLI_OVARIAN_CANCER_LMP”. qPCR подтвердил, что уровни экспрессии CHL1 и CHL1-AS2 были значительно выше в тканях ЭК, нежели в тканях ЭУ и НЭ, в то время как они существенно не отличались в ЭУ по сравнению с тканями НЭ.
Относительные уровни экспрессии CHL1 и CHL1-AS2 в ЭК по сравнению с тканями ЭУ обладают достоверной положительной корреляцией (коэффициент корреляции Пирсона = 0,421 и значение Р = 0,02). Повышенная экспрессия белка CHL1 в тканях ЭК была обнаружена методом вестерн-блоттинга. ИГХ анализ показал, что уровни экспрессии белка CHL1 увеличиваются в эктопических эндометриальных железах и строме.
ВЫВОДЫ
Наши результаты указывают на достоверную корреляцию между CHL1, CHL1-AS1 и CHL1-AS2, которые могут быть вовлечены в развитие ЭМ яичников и служить новыми мишенями для будущих исследований.
Chen Zhanga, Wei Wub, Xue Yea, Ruiqiong Maa, Jianjun Luob, Honglan Zhu
DOI: https://doi.org/10.1016/j.ejogrb.2019.03.020